Целью деятельности Учреждения является формирование единой информационной системы здравоохранения Российской Федерации путем организации на базе современных компьютерных технологий межотраслевой системы сбора, обработки, хранения и предоставления информации, обеспечивающей динамическую оценку состояния здоровья и информационную поддержку принятия решений, направленных на его улучшение. Предметом деятельности Учреждения является организация сбора, обработки и анализа медицинских статистических данных о сети, кадрах, деятельности учреждений.